Os inimigos ninjas do Land of the Sky, comprometendo vingança, se voltar contra o povo da Vila da Folha para devastando a Sky Country na Segunda Grande Guerra Ninja Mundial.
Enquanto Naruto Uzumaki , Sakura Haruno e Hinata Hyuga acompanhar Amaru e doutor Shinno de volta para sua aldeia, Sai e Shino Aburame destruir a base céu ninja navio. Orochimaru , sofrendo seu corpo expirado, as ordens de Sasuke para obter um homem ajudando-o a aperfeiçoar sua reencarnação. Na aldeia em chamas, Amaru procura por todos e as armadilhas aparentemente matar Shinno. Depois Amaru recupera o sentido, eles continuam a encontrá-los. Após Hinata é separada da equipe, Amaru é possuída pelo monstro Zero-atada Reibi. Naruto se transforma em um demônio, mas o selo suprime a Raposa de Nove Caudas chakra dentro dele e Amaru resiste o poder de destruir Reibi. Na fortaleza flutuante Ancor Vantian, Naruto descobre que o Shinno recuperado traído, usado Amaru para pesquisar o poder das trevas há quinze anos e pergaminho secreto da aldeia. Depois Shinno ativa temporariamente técnica corporal Revival, Naruto pára Amaru de cometer suicídio e, apesar de suas memórias. Sasuke intervém o ataque e conta a Shinno enfraquecida para ajudar Orochimaru, mas Shinno recusa, dá o pergaminho reencarnação jutsu de Sasuke e cai no alçapão. Naruto e Sasuke confrontar Shinno revelando o casulo gigante para ser o zero-caudas e transformar em um monstro absorvendo chakra. Depois de Sasuke libera a marca de maldição e Naruto com o chakra da raposa, eles sobrecarregar para derrotar Shinno com o relâmpago Blade e Tornado Rasengan, fazendo com que a base a cair. Enquanto os ninjas folha infiltrar para destruí-la, Amaru, Hinata e os aldeões libertados preparar para sair. Depois de Naruto destrói a fortaleza com o Rasengan ( 螺旋丸lit. esfera espiral, Inglês mangá: "Espiral Chakra Sphere" ) e cai através do céu, Amaru cavalga sobre o planador para salvá-lo. Eles desembarcaram com segurança em Gamabunta.
Depois de voltar para o esconderijo e dando o rolo para Orochimaru, Sasuke continua treinamento.